本发明涉及用于选择质谱中用于片段化的样品多肽的母离子的方法，以及确定样品多肽的至少一个推定的氨基酸序列的方法，以及用于同样目的的设备和计算机程序。所述用于选择母离子的方法包括步骤(i)从所述软电离质谱确定至少两个候选m/z峰集合，每个候选m/z峰集合中的每个m/z峰与其至少一个邻元相差一个氨基酸的质量，并从每个候选m/z峰集合确定推定的氨基酸序列，每个氨基酸序列是对应于每个m/z峰与其至少一个邻元之间的质量差的那些氨基酸的序列；和(ii)采用人工智能技术分析所述至少两个候选m/z峰集合的所述m/z峰，以选择至少一个m/z峰用于片段化。